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微核最好数据+支持免测+二次筛选

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5大板块 | 于集成机器学习联合策略筛选生物标志物(biomarkers) – 知乎

最佳筛选算法的选择 标志物筛选的本质则是从庞大复杂的特征数据(各种组学数据、生化指标和类别数据等)中高效筛选到简单组合的、可以代表整体数据特性的一组特征( panel ),这一组特征能很好地为我们所用(分类,预测等)。 由于不同的特征数据存在着不同特征分布,而单一筛选算法往往只适合某一类数据,那么首先则需要找到适合于待筛选数据特征的模型,进而选择最优的模型作为标志物筛选的算法。 最佳模型的选用是以模型(在默认参数下,避免模型的过拟合)的 6 大评价指标为依据,分别为 准确度(Accuracy) 、 AUC 、 召回率 (Recall) 、 精确率(Precision) 、 F1值(F1 Score)、Kappa系数(Kappa) 。


高内涵筛选缘何成为新药研发的宠儿? – 知乎 – 知乎专栏

显微荧光标记、数码影像分析以及图像数据处理技术的快速发展,使以高通量方式对细胞的多个生理环节进行检测成为可能,有力推动了高内涵筛选(High content screening,HCS)技术的进步。 本文带您快速了解高内涵筛的前世今生,并介绍主流产品技术,希望在您下次入手高内涵筛选时有所帮助。 高内涵筛选的发展历程 前世今生 高通量筛选(High-Throughput Screening,HTS)是20世纪80年代中期产生的为寻找药物先导物针对大量样品进行药理活性评价分析的一种技术手段,在创新药物的研究和开发中发挥了重要作用。


郭国骥教授团队Cell Discovery杂志发文展示可用于高通量筛选的高通量单细胞测序平台-Microwell-seq 2.0

2018年郭国骥教授团队使用自主研发的低成本、高效率、完全国产化的高通量单细胞测序平台Microwell-seq完成了首个哺乳动物单细胞图谱(MouseCellAtlas),相关成果发表在Cell杂志上(HanX,WangR,etal.2018)。. 为了满足研究人员日益增长的单细胞测序细胞通量需求,郭国 …


综述丨中国农科院牧医所: 利用宏基因组数据培养未培养微生物的机遇与挑战(国人佳作)|宏基因组|微生物群|微生物|抗生素|细菌|细胞|-健康界

短读长(如100-150 bp)下一代测序(NGS)技术,如Illumina测序,因其高通量和成本效益而广受欢迎。微生物基因组可以通过短读长测序数据进行组装,但这些宏基因组组装基因组的组装连续性受到重复元件的限制,这可以通过长配对末端方法在一定程度上克服这种限制。


CRISPR/Cas9全基因组筛选在生命科学中的应用

结合单细胞测序技术剖析基因功能关系,下面进行 简要介绍。 2 CRISPR/Cas9 全基因组筛选在疾病研究中 的应用 随着分子生物学和高通量测序技术的发展,人 们对疾病的认识逐渐深入到基因层面。利用CRISPR/ Cas9 全基因组筛选体系发现疾病相关基因,为临床


MSI检测,选NGS还是PCR? – 健康界

面对海量的下机数据,思路迪ngs检测可以自动化的进行生信分析并生成报告,避免人为读图带来误差(图2)。 而PCR检测MSI状态通过人工判读正常对照样本中的有效峰和肿瘤样本中的位移峰,确定断点是否稳定,进行微卫星状态的判定,可能出现主观判断的误差。


计算机辅助筛选核酸适配体技术 – Chinese Journal of …

计算机信息技术已经渗透到我们生活的方方面面,不仅可以辅助药物的筛选,也能够模拟药物的作用。目前已有研究使用计算机辅助技术筛选适配体,对筛选效率的提升和筛选高亲和力的适配体有着重要的指导作用。文中将主要对计算机通过序列评估、结构分析、分子对接3个方面辅助适配体筛选的 …


定向进化技术的最新进展 – Chinese Journal of Biochemistry and …

在当前第3次酶改造浪潮中,基于计算机辅助设计和大尺度的分子动力学模拟可高效、快捷地改造和筛选生物催化剂 [26-27] ,不仅可高精度地预测蛋白结构 ,还可从头设计自然界中不存在的新酶 ,以及对现有酶进行改造,赋予其新功能。


微生物源农用抗生素的研发与高产策略

3 发酵优化提高菌株高产能力. 微生物源农用抗生素的筛选以及高产菌株生产能力的鉴定一般都是通过发酵实现的,发酵过程会受到各种因素 (如营养因素、氧气供应、温度、pH值等) 的影响,进而影响微生物次级代谢产物的合成水平。. 如在 S. hygroscopicus 5008发酵 …

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